วิธีการคำนวณภาษีกรณีพิเศษเมื่อตรวจสอบภาษี  คือ  คำนวณโดยวิธีหามูลค่าเพิ่มของทส.สุทธิขึ้น บวกคชจ.ที่ไม่เกี่ยวกับการหารายได้ เพื่อถือเป็นเงินได้สุทธิ นำมาคำนวณภาษี

อนุสัญญาภาษีซ้อน

• ยกเว้นหรือลดภาษีจากอัตราที่กำหนดไว้ในประมวลรัษฎากร
• ป้องกันการเก็บภาษีซ้อน โดยการยกเว้นและเครดิตภาษีให้ซึ่งกันและกัน

โครงสร้างกม.ภาษีอากร อาจแบ่งเป็น 6 หัวข้อสำคัญ

1. ผู้มีหน้าที่เสียภาษีอากร
2. ฐานภาษีอากร
3. อัตราภาษีอากร     ( แบบคงที่ – ภาษีนิติบุคคล / vat     ,  แบบก้าวหน้า – ภาษีบุคคลธรรมดา   ,  แบบถดถอย – ภาษีบำรุงท้องที่ )
4. การประเมินจัดเก็บภาษีอากร  ( ประเมินตนเอง , เจ้าหน้าที่ประเมิน , การหักภาษี ณ ที่จ่าย )
5. การอุทธรณ์ภาษีอากร
6. เบี้ยปรับ เงินเพิ่ม และโทษ